הרמטכ"ל, רב-אלוף משה יעלון, מינה ועדה שתבחן את מדיניות הריסת הבתים של צה"ל בשטחים. במקביל, מתנהלת בדיקה נפרדת של פרשה שאירעה בחאן יונס, שבה נהרסו כ-25 בתים, בלא שהתקבל האישור הנדרש מהדרגים המתאימים.

בראש הוועדה, שאמורה להגיש את מסקנותיה ליעלון בתקופה הקרובה, עומד האלוף אודי שני, ראש אגף התקשוב. האלוף שני סייר בגזרות השונות - בגדה וברצועת עזה - ושוחח עם קצינים על הריסת הבתים. הכוונה לבחון את יעילות השימוש באמצעי זה בשני מישורים: כעונש, שמטרתו המוצהרת הרתעתית, כלפי משפחות מחבלים ובעיקר מתאבדים (שיטה הנהוגה בעיקר בגדה); וכן לצרכים טקטיים: הרחקת הירי והמטענים מהתנחלויות ומוצבים.

מנתונים שמסר בעבר צה"ל, מאז החליטה הממשלה על חידוש הריסות הבתים בקיץ 2002 ועד הקיץ האחרון, צה"ל הרס כ-270 בתים מרביתם בגדה. תחילה הופעלה הענישה רק כלפי מתאבדים, ואולם בשלבים שונים נהרסו גם בתים של מעורבים בפיגועי ירי.

בצה"ל יש מחלוקת באשר למשמעותו המוסרית ומידת יעילותו של אמצעי הריסת הבתים. האלוף (מיל') יצחק איתן, שהיה אלוף פיקוד מרכז בשנתיים הראשונות לאינתיפאדה, טען כי הריסת בתים לא מרתיעה - אלא מעוררת רגשי נקם. גם דו"ח פנימי בצה"ל לסיכום 1,000 ימי הלחימה הראשונים שהופץ בקיץ 2003, קובע שאין הוכחות שהריסת הבתים מרתיעה וכי מספר הפיגועים אף עלה בחודשים שלאחר יישום המדיניות החדשה.

מטרה משנית של ועדת שני תהיה להסדיר נהלים יותר ברורים בכל הנוגע להרס בתים, ולבחון אם שיטת האישורים עומדת במבחנים המשפטיים; זאת לאחר כמה מקרים שבהם נהרסו בתים במהלך פעולות צה"ל, בלא שניתנו כל האישורים המתאימים. הדבר אירע במבצע "קשת בענן" ברפיח.

תקלה נוספת אירעה לפני כמה חודשים בעת פעילות צה"ל בחאן יונס. הכוחות הרסו כ-25 בתים, שלדברי הצבא היו בנויים למחצה (בלא גגות). בדיעבר, התברר שההחלטה התקבלה באוגדת עזה מבלי שפיקוד דרום עודכן או אישר. בעקבות המקרה התנהל תחקיר בפיקוד דרום, שבו נמתחה ביקורת על הליכי האישור ועל מידת הפיקוח למבצע; ואולם, בתחקיר נאמר שגם אם היתה פנייה מסודרת - סביר שהפיקוד היה מאשר את הריסת רוב הבתים. ממצאי התחקיר יוצגו בקרוב לרמטכ"ל. מקורות צבאיים העריכו שייתכנו צעדים משמעתיים נגד המעורבים בפרשה.